Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NLRC3Q7RTR2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NLRC3Q7RTR2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms