Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRADAQ7RTN6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRADAQ7RTN6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRADAQ7RTN6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms