Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMUB2Q71RG4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMUB2Q71RG4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMUB2Q71RG4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms