Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD7Q6ZUT3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD7Q6ZUT3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms