Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPGS1Q6ZTW0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPGS1Q6ZTW0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms