Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM43BQ6ZT52 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM43BQ6ZT52 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM43BQ6ZT52 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM43BQ6ZT52 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM43BQ6ZT52 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM43BQ6ZT52 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM43BQ6ZT52 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM43BQ6ZT52 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM43BQ6ZT52 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM43BQ6ZT52 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM43BQ6ZT52 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms