Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSZ5

ARHGEF18, Rho guanine nucleotide exchange factor 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF18Q6ZSZ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF18Q6ZSZ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF18Q6ZSZ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms