Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf47Q6ZRZ4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms