Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NSMFQ6X4W1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSMFQ6X4W1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms