Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP12Q6UXS9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CASP12Q6UXS9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP12Q6UXS9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms