Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG3Q6UXM1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms