Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGM2L1Q6PCE3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGM2L1Q6PCE3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM2L1Q6PCE3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM2L1Q6PCE3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM2L1Q6PCE3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM2L1Q6PCE3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM2L1Q6PCE3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGM2L1Q6PCE3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms