Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFWD3Q6PCD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms