Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A1Q6PCB7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A1Q6PCB7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms