Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF549Q6P9A3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF549Q6P9A3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF549Q6P9A3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms