Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETSATQ6NUM9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETSATQ6NUM9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms