Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC8EQ6NSJ5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC8EQ6NSJ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC8EQ6NSJ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms