Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4GALNT3Q6L9W6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4GALNT3Q6L9W6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4GALNT3Q6L9W6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4GALNT3Q6L9W6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4GALNT3Q6L9W6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
B4GALNT3Q6L9W6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
B4GALNT3Q6L9W6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
B4GALNT3Q6L9W6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4GALNT3Q6L9W6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4GALNT3Q6L9W6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms