Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms