Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCA2Q69YH5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms