Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CREB3L3Q68CJ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CREB3L3Q68CJ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREB3L3Q68CJ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms