Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf57Q5W0N0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf57Q5W0N0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf57Q5W0N0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms