Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MALRD1Q5VYJ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MALRD1Q5VYJ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MALRD1Q5VYJ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms