Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYOM3Q5VTT5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYOM3Q5VTT5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
MYOM3Q5VTT5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms