Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPANXN1Q5VSR9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPANXN1Q5VSR9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms