Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAMD5Q5TGI4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD5Q5TGI4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms