Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.2■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
CCDC18Q5T9S5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CCDC18Q5T9S5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CCDC18Q5T9S5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms