Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC183Q5T5S1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC183Q5T5S1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC183Q5T5S1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.2 ms