Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HECTD3Q5T447 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECTD3Q5T447 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms