Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
FRMPD1Q5SYB0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FRMPD1Q5SYB0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms