Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAPCD1Q5SSQ6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms