Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HP1BP3Q5SSJ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HP1BP3Q5SSJ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HP1BP3Q5SSJ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms