Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC39AQ5SRH9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39AQ5SRH9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms