Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTSL3PQ5NE16 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTSL3PQ5NE16 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms