Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COLEC12Q5KU26 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COLEC12Q5KU26 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms