Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PITRM1Q5JRX3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms