Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGO2Q562F6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms