Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB6CQ53S08 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB6CQ53S08 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6CQ53S08 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms