Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HSD17B12Q53GQ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HSD17B12Q53GQ0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms