Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CEP55Q53EZ4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP55Q53EZ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP55Q53EZ4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms