Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SBK1Q52WX2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SBK1Q52WX2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms