Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKDCCQ504Y2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms