Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A12Q504Y0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC39A12Q504Y0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms