Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM259Q4ZIN3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms