Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP13A4Q4VNC1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A4Q4VNC1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms