Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R8

SLC22A6, Solute carrier family 22 member 6, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A6Q4U2R8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC22A6Q4U2R8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC22A6Q4U2R8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms