Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01620Q4KN68 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01620Q4KN68 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms