Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LONRF3Q496Y0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LONRF3Q496Y0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms