Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF212Q495C1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF212Q495C1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms