Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SP6Q3SY56 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SP6Q3SY56 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms